新冠病毒毒株研究:溯源欧洲和美国新冠大流行的源头
德国遏制了欧洲首次新冠爆发,但是第二次新冠爆发才导致该病毒在欧洲的广泛传播。研究人员追踪了各种Sars-CoV-2病毒株,并展示了新冠如何到达欧洲。2020年1月在德国发生第一批新冠病例时,并非欧洲新冠大流行的起点。根据基因分析现已证实,欧洲的首次在慕尼黑的新冠爆发已得到成功遏制。Sars-CoV-2病毒从中国引入意大利后才开始传播。在美国的情况也是一样,因为第二次引进造成了大流行的破口导致之后的乘风破浪。
新冠从中国武汉爆发以来,已蔓延至世界各地。尽管冠状病毒的突变率相当低,研究人员还是创建了Sars-CoV-2的许多略有不同的变体,通过识别各种病毒系之间的细微差别,重新构建该病毒的传播途径,复盘整个大流行的传播过程。
溯源欧美大流行的起点
亚利桑那大学的迈克尔·沃罗贝(Michael Worobey)及其同事研究了新冠病毒如何以及何时传播到欧洲和美国。他们比较了两个地区中最早的Covid-19病例的病毒RNA序列。在美国,这是自2020年1月15日起在华盛顿州的一个感染群,在欧洲,首例病例发生在2020年1月下旬在巴伐利亚,然后在2月初在意大利。
基于这些最初的案例,研究人员模拟了SARS-CoV-2的不同传播场景,然后将其结果与现场获得的病毒基因组和流行病学数据进行了比较。 沃罗贝表示:“可以说,这种回溯,让我们不断观察到这种流行病的展开传播。” “通过这种方式,我们能够将模拟获得的场景与现实中看到的情形进行比较。”
欧洲:巴伐利亚疫情爆发被遏止了
研究结果表明:最初进入欧洲和美国的病毒没有形成流行,早期的遏制措施最初阻止了进一步的传播。研究人员报告说:“后来该病毒从中国向意大利和华盛顿进入后,才在欧洲和美国建立第一个感染网络。”
具体来说,巴伐利亚汽车供应商Webasto的中国员工于2020年1月20日输入的病毒变体导致了短链感染。但是,通过迅速隔离和后续行动,制止进一步蔓延成为可能。该Sars-CoV-2变体的基因源头与武汉疫情的病毒相同,而且在之后的欧洲案例中没有再次出现。
德国不是意大利爆发的起源
分析还阐明了意大利北部的感染事件是欧洲重大疫情的来源。巴伐利亚州的首个感染群经由旅行者携带到意大利是不可能的。“根据基因数据,意大利爆发中没有一种病毒与巴伐利亚种束相同。”沃罗贝和他的团队说。
相反,从2020年2月开始在意大利北部分离出的所有冠状病毒样本与巴伐利亚感染群至少相差一个突变。研究人员指出:“我们的数据和模拟包含了这种病毒从中国首先引入德国,然后再进入意大利的情况。”可是根据数据表明,意大利北部的爆发始于2020年1月28日左右从湖北直接引入的Sars-CoV-2。该病毒之后从意大利通过旅行者再次带入德国和其他欧洲国家。
据沃罗贝的研究报告,这种病毒变体于2月12日被带入纽约市,引发了严重的爆发。
美国:1月西雅图的输入病例不是美国的源头
该研究还提供了对美国西海岸感染过程的新见解。美国的首次新冠病毒输入系列案件也被有效遏制。正如基因比较所显示的那样,索引病例的病毒变体来自一名中国女性,她于1月15日从武汉到达西雅图。然而该病毒变体没有再度引发后续的感染事件。
取而代之的是,在接下来的几周中抽取的大多数Covid 19感染患者都携带了冠状病毒的轻微变异。流行病学模拟研究否定了将其作为随后发展的流行病索引案例的推断。研究的推断结论为,美国西海岸首次大规模感染暴发是由2020年2月1日左右从中国再次输入病例所致。
火花还是飞溅出来
根据研究人员的说法,这些结果表明,西雅图和巴伐利亚州当局的迅速反应以及早期的遏制措施至少已延迟了德国和美国大流行的开始。当来自中国的旅行者将Sars-CoV-2再次和多次带到意大利和美国时,该病毒未被识别,才得以迅速传播。
沃罗贝表示:“早期措施意味着仍然可以成功灭掉第一波火花。” “该流行病最终得以解决,是一个早期的胜利,它也向我们展示了,广泛的测试和案件追踪是强大的武器。”
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